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首页 > 产品服务 > CRISPR/Cas9基因编辑服务

单克隆基因敲除细胞株

Monoclonal KO Cell

CRISPR/Cas9 通过 sgRNA 引导 Cas9 核酸酶在基因组特定位点产生双链断裂,细胞在修复过程中产生插入或缺失突变,导致基因移码与功能丧失。

本服务主要采用慢病毒递送 CRISPR 系统(质粒系统亦可选择),可绕开部分细胞质粒转染效率低的问题,提高难转染细胞的编辑阳性细胞比例,为单克隆筛选提供足够的候选细胞。感染并富集后,通过有限稀释法挑取单克隆,扩增后获得基因型一致的单克隆敲除细胞株。

服务概述
单克隆或混合克隆
影响实验可重复性与项目报价,需在方案阶段确定。
多重质控
细胞来源、递送与编辑效率、突变验证,均有对应报告支持。
交付内容
冻存管或活细胞交付、STR 报告、测序报告、培养条件说明等。
基因敲除服务类型

根据靶点数、编辑方式与调控需求,提供以下五类敲除服务,覆盖从常规功能丧失到时空特异性调控的研究场景。

按靶基因数量
01

单基因敲除

针对单个目标基因设计 sgRNA,实现该基因的完全功能丧失。

单基因功能研究药物靶点验证
02

多基因敲除

同时针对多个目标基因设计 sgRNA 组合,实现多个基因的同时敲除。

基因互作研究功能冗余分析代偿机制解析
按编辑方式
03

移码敲除

在编码基因的编码区前端设计 sgRNA,引入非 3 倍数 indel,造成移码突变。

编码蛋白基因功能丧失研究
04

片段敲除

设计双gRNA 靶向基因两端,删除中间大段编码序列或功能结构域。

功能结构域删除lncRNA 敲除大片段缺失研究
05

条件性敲除

利用 Cre-loxP 系统或诱导型 Cas9 系统,实现时空特异性基因敲除。

必需基因研究发育时序研究组织特异性敲除
单克隆基因敲除细胞株构建流程

从方案设计到冻存交付共 8 个节点:先完成靶点与 sgRNA 评估,再以慢病毒递送编辑元件,经药筛富集、有限稀释挑取单克隆后完成基因型鉴定,最终按标准规格冻存交付。整体周期取决于细胞系培养和感染特性,靶基因敲除难度与单克隆筛选轮次;若仅需验证 sgRNA 活性或做早期表型初筛,也可先选择混合克隆方案,具体排期请在方案阶段确认。

01

需求确认与方案设计

确认靶点与细胞系,评估可行性

02

sgRNA 设计与筛选

每个靶点设计3–4 条sgRNA

03

载体构建与病毒包装

克隆骨架,慢病毒包装与滴度测定

04

细胞感染与药筛富集

感染后抗性筛选/荧光富集

05

有限稀释与单克隆挑取

单细胞密度挑取单克隆

06

基因型鉴定

T 载体测序确认突变

07

扩增、冻存与交付准备

克隆扩增冻存,备报告

08

交付

冻存管或活细胞交付,含备份与报告

交付
适用细胞
细胞类型 常用具体细胞株 编辑难度 经典应用场景
肿瘤细胞系 A549、HepG2、HCT116、HeLa 易 基因功能、增殖/凋亡、药物靶点验证
工具与模型细胞系 HEK293 / HEK293T、CHO 中 代谢研究、毒性评价、对照实验
免疫与血液细胞系 THP-1、RAW264.7、Jurkat 中 信号通路研究、基因编辑验证、血液/免疫相关基因功能与机制研究
干细胞 人iPSC、小鼠ESC 较难 疾病建模、基因功能敲除模型构建、嵌合体实验
原代 / 初代细胞 原代 T 细胞、原代肝细胞 极难 免疫、药物代谢等生理相关机制研究

如不确定目标细胞系是否适用,可在方案阶段提供细胞系名称,我们将评估可行性与预期编辑效率。

常见用途

基因功能研究

Gene Function

敲除候选基因,观察表型变化,初步判断基因在细胞中的功能角色。

表型观察功能缺失机制初探

药物靶点验证

Target Validation

评估增殖、凋亡与药物敏感性,验证候选基因是否为有效药物靶点。

增殖·凋亡药物敏感性靶点确证

信号通路解析

Pathway Analysis

多基因敲除以考察基因家族冗余,解析上下游信号通路的调控关系。

多基因敲除通路冗余家族分析

疾病模型构建

Disease Model

在疾病相关细胞系中引入敲除,结合后续组学分析构建体外疾病模型。

疾病细胞系组学分析模型构建
多重质控体系

从细胞入库到最终交付,设置 实验前 → 实验中 → 交付前 三大阶段质控,逐项把关细胞身份、编辑效率与敲除性状,确保每一株交付细胞基因型明确、性状稳定。

01

实验前质控

从源头把控细胞质量,避免身份错误与隐性污染影响后续编辑。

质控项

  • 细胞来源可靠:汉恒采购细胞为中科院来源,提供 STR 鉴定报告,身份明确、无交叉污染。
  • 客户细胞可选 STR 鉴定服务:用户提供细胞时,可在方案阶段加选 STR 鉴定。
  • 支原体检测:细胞入库前完成支原体检测,排除常见隐性污染。
02

实验中质控

在编辑与筛选各环节设卡,提高阳性比例与单克隆源性可靠性。

质控项

  • 慢病毒高效递送:绕开部分细胞质粒转染效率低的问题,提升编辑阳性细胞比例。
  • sgRNA 多重评选:每靶点设计 3–4 条 sgRNA 并联评估,兼顾活性与脱靶风险。
  • 单克隆源性确认:有限稀释至单细胞密度挑取,确保来源为单个细胞。
03

交付前质控

交付前完成基因型与性状确认,附完整报告与备份管。

质控项

  • 基因型鉴定:T 载体测序确认突变类型与等位基因编辑情况。
  • 蛋白水平验证(可选,需另支付费用):Western blot确认目的蛋白缺失。
  • 冻存与备份:标准规格冻存交付(也可交付活细胞),含备份管与完整质量报告。
交付标准与验收
交付项 规格 说明
敲除细胞株 冻存管形式或活细胞交付,含备份管 不低于 5×106 每管
STR 鉴定报告(客户提供细胞可选) 1 份 确认细胞身份,无交叉污染
T 载体测序报告 1 份 确认突变类型与等位基因编辑情况
培养条件说明 1 份 含培养基、传代比例与冻存复苏建议
对照细胞 野生型或对照株 按项目需求确认是否包含
WB 验证报告(可选) 按需提供 蛋白水平佐证,需评估抗体可用性
交付案例
CRISPR/Cas9慢病毒助力三阴性乳腺癌CD36抑癌及铁死亡机制研究
MedComm 14.1

CD36 Inhibits Triple-Negative Breast Cancer Progression by Transcriptionally Upregulating Caveolin-1 and Promoting Lipid-Reactive Oxygen Species-Related Ferroptosis


文章 Figure 2 A,C:流式细胞术验证 CD36 敲除和过表达效果
客户单位陆军军医大学第一附属医院
使用产品CD36基因敲除TNBC细胞株
产品信息gRNA-Cas9慢病毒构建了 CD36 基因敲除的 MDA-MB-231 三阴性乳腺癌细胞系,用于研究 CD36 在 TNBC 中的功能及机制。
使用方式使用LentiCRISPR-v2构建sgCD36质粒与pMD2.G及psPAX2质粒包装慢病毒构建CD36基因敲除细胞株
gRNA-Cas9慢病毒 CRISPR/Cas9 系统构建了 CD36 敲除 TNBC 细胞系,作为功能丧失实验的核心工具,证明了 CD36 通过 PPARγ/CAV1 轴促进脂质 ROS 相关铁死亡,从而抑制三阴性乳腺癌进展和转移。
常见问题
单克隆和混合克隆有什么区别,选哪个?
混合克隆是不同编辑类型细胞的混合群体,成本低、周期短,适用于 sgRNA 效率验证和早期表型筛查;单克隆由单个细胞扩增而来,基因型一致,适用于机制研究、正式实验和发表。若后续需长期传代或重复实验,建议选择单克隆。
能保证敲除效率或成功率吗?
不能承诺所有项目均获得目标克隆。编辑效率受靶位点、细胞类型、递送方式和筛选策略影响。可保证 sgRNA 经过设计与筛选、测序验证完整、交付克隆的基因型明确;若首轮未获得合格克隆,提供备选 sgRNA 方案。
需要多长时间?
周期取决于细胞系培养和感染特性、靶基因敲除难度、编辑效率和单克隆筛选轮次。具体周期需和您的客户经理确认项目周期实况。单克隆较混合克隆额外增加有限稀释、克隆扩增与鉴定时间。
可以指定细胞系吗?
可以。建议由客户指定实验所需细胞系。对于特殊或培养难度较大的细胞系,我们会在方案阶段评估可行性、培养条件及对周期和效率的影响。
交付的细胞株能传多少代?
交付细胞株在推荐培养条件下可正常传代;具体传代稳定性因细胞系和靶基因而异,培养与复苏建议随报告提供。建议实验前进行基因型复检和支原体检测。
能同时敲除两个基因吗?
可以。多基因同时敲除的难度随基因数量增加,需在方案设计阶段评估可行性与筛选策略。
鉴定方法有哪些,能做 WB 吗?
常见的有三种。①测序鉴定,单克隆 PCR 扩增靶位点后 Sanger 测序,明确突变类型与等位基因编辑情况;必要时 T 载体克隆测序;②酶切鉴定,若编辑位点覆盖某一内切酶识别序列,可通过 PCR 产物酶切初步判断;③蛋白水平鉴定,Western blot 检测目的蛋白是否缺失;抗体特异性良好时可考虑 dot blot。需在方案阶段评估抗体可用性。
单克隆是怎么挑出来的?
实验室常用三种方式。有限稀释法,将细胞悬液梯度稀释至极低密度后接种 96 孔板,筛选单细胞来源克隆,为默认方法;平皿克隆分离法,利用预置小盖玻片或金属套环配合消化液分离克隆;软琼脂克隆分离法,适用于悬浮细胞。
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