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microRNA(miRNA)是一类内生的、长度约20-24个核苷酸的小RNA,一个miRNA可以靶向几个不同基因进行调节,同时几个miRNAs也可以调节同一个基因。miRNA可以与编码基因mRNA的3’UTR结合也可以直接与circRNA或lncRNA结合来调控相关基因的表达。
汉恒生物所使用的荧光素酶报告基因载体psi-CHECK2采用了萤火虫/海肾双荧光素酶报告基因系统,其中海肾荧光素酶作为检测报告基因,而萤火虫荧光素酶则作为内参报告基因。验证miRNA与mRNA/lncRNA/circRNA的互作,将要研究的靶点序列(序列可以是mRNA的3’UTR,也可以是lncRNA/circRNA序列)插入到报告载体中,作为萤火虫荧光素酶的3‘UTR,与miRNA的mimic共同转染细胞,如果荧光素酶表达量下降(荧光信号下降),提示序列包含miRNA的靶点。
在验证circRNA/lncRNA与miRNA的靶点产生竞争性结合时,可以在转染报告质粒和mimics的基础上转染认为有竞争结合位点的circRNA/lncRNA过表达质粒或者将具有竞争性结合位点的circRNA/lncRNA敲低,观察R-Luciferase活性的改变。当过表达circRNA/lncRNA时荧光素酶活性升高,或者敲低circRNA/lncRNA时荧光素酶活性降低则表明他们之间存在对miRNA的竞争性结合,反之则不存在竞争性结合。
pSI-check2 质粒图谱
验证miroRNA与其靶基因的相互作用最常用的方法便是双荧光素酶验证试验。
荧光素(Luciferase)是自然界中能够产生生物发光的酶的统称,其中最有代表性的是来自萤火虫 (Firefly) 体内和海肾(Renilla)体内的两类萤光素酶,分别命名为F-Luciferase和R-Luciferase。
这两种荧光素酶作用方式不同。一是底物和辅助因子不同,萤火虫荧光素酶需要荧光素、O2、ATP 和 Mg2+,而海肾荧光素酶仅需要腔肠素(coelenterazine)和 O2。二是发光颜色不同,萤火虫荧光素酶产生黄绿色光,发光波长为 560 nm;而海肾荧光素酶产生蓝光,发光波长为 465 nm。常应用于启动子转录活性调控及miRNA靶基因验证等研究。
microRNA靶基因结合验证:验证microRNA与靶基因(mRNA,lncRNA,circRNA)结合作用
ceRNA作用研究:验证不同把好基因对microRNA的竞争性结合作用
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